Многоволновая аномальная дисперсия - Multi-wavelength anomalous dispersion

Многоволновая аномальная дифракция (иногда Многоволновая аномальная дисперсия ; сокращенно MAD ) - это метод, используемый в рентгеновской кристаллографии, который облегчает определение трехмерной структуры биологических макромолекул (например, ДНК, рецепторов лекарств) через раствор фазы. проблема .

MAD был разработан Уэйном Хендриксоном, когда он работал докторантом под руководством Джерома Карла в Лаборатории военно-морских исследований США . Математика, на которой основывались MAD (и предшественник аномальной дисперсии на одной длине волны ), была разработана Джеромом Карле , за работу которого он был удостоен Нобелевской премии по химии 1985 года (вместе с Гербертом Хауптманом ).

Смотрите также

• Одноволновая аномальная дисперсия (SAD)
• Множественная изоморфная замена (MIR)
• Аномальное рассеяние
• Аномальное рассеяние рентгеновских лучей
• Карта Паттерсона

Рекомендации

дальнейшее чтение

• Хендриксон WA (1985). «Анализ структуры белка по дифракционным измерениям на множестве длин волн». Сделки ACA . 21 .
• Карл Дж (1980). "Некоторые разработки в области аномальной дисперсии для структурных исследований макромолекулярных систем в биологии". Международный журнал квантовой химии: симпозиум по квантовой биологии . 7 : 357–367. DOI : 10.1002 / qua.560180734 .
• Карл Дж (1989). «Линейный алгебраический анализ структур с одним преобладающим типом аномального рассеивателя» . Acta Crystallographica . 45 (4): 303–307. DOI : 10.1107 / s0108767388013042 . PMID   2559755 .
• Палер А., Смит Дж. Л., Хендриксон В. А. (1990). «Вероятностное представление информации о фазе из многоволновой аномальной дисперсии» . Acta Crystallographica . 46 (7): 537–540. DOI : 10.1107 / s0108767390002379 .
• Тервиллигер TC (1994). «MAD Phasing: байесовские оценки FA» . Acta Crystallographica D . 50 : 11–16. DOI : 10.1107 / s0907444993008224 .
• Тервиллигер TC (1994). «Стадия MAD: обработка дисперсионных различий как информации об изоморфном замещении» . Acta Crystallographica D . 50 (Pt 1): 17–23. DOI : 10.1107 / s0907444993008236 . PMID   15299472 .
• Fourme R, Shepard W., Kahn R, l'Hermite G, de La Sierra, Иллинойс (1995). «Метод многоволновой аномальной контрастности растворителя (MASC) в макроколекулярной кристаллографии». Журнал синхротронного излучения . 2 (Pt 1): 36–48. DOI : 10.1107 / S0909049594006680 . PMID   16714785 .
• de la Fortelle E, Bricogne G (1997). "Максимальное правдоподобие уточнения параметров тяжелых атомов для множественных изоморфных замещений и методов многоволновой аномальной дифракции" . Методы в энзимологии. 276 : 472–494 . DOI : 10.1016 / S0076-6879 (97) 76073-7 . ISBN   978-0-12-182177-7 . PMID   27799110 . Цитировать журнал требует |journal= ( помощь )
• Хендриксон WA, Огата CM (1997). "Определение фазы из измерений аномальной дифракции на многих длинах волн" . Методы в энзимологии. 276 : 494–523 . DOI : 10.1016 / S0076-6879 (97) 76074-9 . ISBN   978-0-12-182177-7 . PMID   27799111 . Цитировать журнал требует |journal= ( помощь )
• Белла Дж, Россманн MG (1998). «Общий алгоритм фазирования для множественных данных MAD и MIR». Acta Crystallographica D . 54 (2): 159–174. DOI : 10.1107 / s0907444997010469 . PMID   9761882 .
• Гусс Дж. М., Мерритт Е. А., Физакерли Р. П., Хедман Б., Мурата М., Ходжсон К. О. , Фриман ХК (1989). «Определение фазы с помощью дифракции рентгеновских лучей с множеством длин волн: кристаллическая структура основного синего белка меди из огурцов». Наука . 241 (4867): 806–811. Bibcode : 1988Sci ... 241..806G . DOI : 10.1126 / science.3406739 . PMID   3406739 .

внешние ссылки

• MAD phasing - подробное руководство с примерами, иллюстрациями и ссылками.
• HHMI Bio для Уэйна Хендриксона
• Домашняя страница Уэйна Хендриксона
• Хендриксон Лаборатория Резюме исследований
• Джером Карл Нобель биография
• Признание НРЛ Нобелевской премии

Компьютерные программы

• Пакет абсорбции SSRL - Бреннан С., Коуэн П.Л. (1992). «Набор программ для расчета характеристик поглощения, отражения и дифракции рентгеновских лучей для различных материалов на произвольных длинах волн» . Обзор научных инструментов . 63 (1): 850. Bibcode : 1992RScI ... 63..850B . DOI : 10.1063 / 1.1142625 .
• CHOOCH - Эванс Г., Петтифер РФ (2001). "CHOOCH: программа для получения факторов аномального рассеяния из спектров рентгеновской флуоресценции" . Журнал прикладной кристаллографии . 34 : 82–86. DOI : 10.1107 / S0021889800014655 .
• Встряхните и испеките ( SnB ) - Смит Г.Д., Нагар Б., Рини Дж. М., Хауптман Г. А., Благословение Р. Х. (1998). «Использование Snb для определения субструктуры аномального рассеяния». Acta Crystallographica D . 54 (Pt 5): 799–804. DOI : 10.1107 / S0907444997018805 . PMID   9757093 .
• SHELX - Шелдрик GM (1998). «ШЕЛКС: приложения к макромолекулам». В С. Фортье (ред.). Прямые методы решения макромолекулярных структур . Дордрехт: Kluwer Academic Publishers. С. 401–411. ISBN   0-7923-4949-0 .

Учебники и примеры

• Эванс, Гвиндаф (октябрь 1994 г.). «Метод множественной аномальной дифракции длин волн с использованием синхротронного излучения при оптимальных энергиях рентгеновского излучения: применение в кристаллографии белков» . Кандидатская диссертация . Уорикский университет.