miRBase - miRBase
Содержание | |
---|---|
Описание | база данных микроРНК |
Связаться с нами | |
Исследовательский центр | Манчестерский университет |
Авторы | Ана Козомара |
Основное цитирование | Козомара и др. (2011) |
Дата выпуска | 2010 г. |
Доступ | |
Веб-сайт | www |
В биоинформатики , miRBase является биологической базой данных , которая действует как архив микроРНК последовательностей и аннотации. По состоянию на сентябрь 2010 г. он содержал информацию о 15 172 микроРНК. К марту 2018 года это число выросло до 38 589. Реестр miRBase представляет собой централизованную систему для присвоения новых имен генам микроРНК.
miRBase выросла из ресурса реестра микроРНК, созданного Сэмом Гриффитс-Джонсом в 2003 году.
По словам Аны Козомары и Сэма Гриффитс-Джонса, miRBase преследует пять целей:
- Обеспечить согласованную систему именования микроРНК
- Обеспечить центральное место для сбора всех известных последовательностей микроРНК
- Предоставлять информацию, читаемую человеком и компьютером, для каждой микроРНК.
- Обеспечить первичные доказательства для каждой микроРНК
- Для агрегирования и связи с целевой информацией о микроРНК
MiRBase содержит miRNA, принадлежащие различным видам, принадлежащим к Alveolata , Chromalveolata , Metazoa , Mycetozoa , Viridiplantae и вирусам . Для Viridiplantae в выпуске 21 (2014 г.) доступны данные по 73 видам . Это включает 4800 уникальных зрелых miRNA и 8480 последовательностей-предшественников.
Текущая версия MiRBase - выпуск 22 (март 2018 г.).
Рекомендации
внешние ссылки
Эта статья, связанная с биологической базой данных, является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |