Коннекограмма - Connectogram
Коннекограммы - это графические изображения коннектомики , области исследований, посвященной отображению и интерпретации всех волоконных соединений белого вещества в человеческом мозге. Эти круговые графики, основанные на данных диффузионной МРТ, используют теорию графов, чтобы продемонстрировать связи белого вещества и корковые характеристики для отдельных структур, отдельных субъектов или популяций.
Состав
Предпосылки и описание
Connectogram , как графическое представление мозга connectomics , был предложен в 2012 году.
Круговые представления связей использовались в ряде дисциплин; Примеры включают представление аспектов эпидемий, географических сетей, музыкальных ритмов, разнообразия популяций птиц и геномных данных. Коннекограммы также были названы источником вдохновения для стиля отображения хедз-ап шлема Тони Старка в Iron Man 3 .
Коннекограммы круглые, левая половина изображает левое полушарие, а правая половина - правое полушарие. Полушария далее подразделяются на лобную долю , островную кору , лимбическую долю , височную долю , теменную долю , затылочную долю , подкорковые структуры и мозжечок . Внизу между двумя полушариями также изображен ствол мозга. Внутри этих долей каждая корковая область помечена аббревиатурой и ей присвоен свой цвет, который можно использовать для обозначения тех же кортикальных областей на других рисунках, таких как парцеллированные поверхности мозга на соседнем изображении, чтобы читатель мог найти соответствующие области коры головного мозга на геометрически точной поверхности и посмотрите, насколько разнородными могут быть соединенные области. Внутри кольца кортикальной поверхности концентрические круги представляют разные атрибуты соответствующих областей коры. В порядке от внешнего к самому внутреннему эти метрические кольца представляют объем серого вещества , площадь поверхности , толщину коры, кривизну и степень связности (относительную долю волокон, начинающихся или заканчивающихся в этой области, по сравнению со всем мозгом). Внутри этих кругов линии соединяют области, которые оказались структурно связанными. Относительная плотность (количество волокон) этих соединений отражается в непрозрачности линий, так что можно легко сравнивать различные соединения и их структурное значение. Дробная анизотропия каждого соединения отражается в его цвете.
Использует
Картирование мозга
В связи с недавним согласованным стремлением отобразить весь человеческий мозг и его связи, становится все более важным найти способы графического представления больших объемов данных, задействованных в коннектомике . Большинство других представлений коннектома используют 3 измерения и, следовательно, требуют интерактивного графического пользовательского интерфейса. Коннектограмма может отображать 83 области коры в каждом полушарии и визуально отображать, какие области структурно связаны, все на плоской поверхности. Поэтому его удобно хранить в картах пациентов или отображать в печати. Графики изначально были разработаны с использованием инструмента визуализации под названием Circos ,.
Клиническое использование
На индивидуальном уровне коннекограммы могут использоваться для информирования о лечении пациентов с нейроанатомическими аномалиями. Коннекограммы использовались для наблюдения за прогрессированием неврологического выздоровления пациентов, перенесших черепно-мозговую травму (ЧМТ). Они также применялись к известному пациенту Финеасу Гейджу , чтобы оценить повреждение его нейронной сети (а также повреждение на корковом уровне - основное внимание в более ранних исследованиях Гейджа).
Эмпирическое исследование
Коннекограммы могут представлять средние показатели коры головного мозга (объем серого вещества, площадь поверхности, толщина коры, кривизна и степень связности), а также данные трактографии , такие как средняя плотность и фракционная анизотропия соединений, в популяциях любого размера. . Это позволяет проводить визуальное и статистическое сравнение между группами, такими как мужчины и женщины, разные возрастные когорты или здоровые контрольные группы и пациенты. Некоторые версии использовались для анализа разбиения сетей в популяциях пациентов или относительного баланса между меж- и внутриполушарными связями.
Измененные версии
Есть много возможностей, для которых меры включены в кольца коннекограммы. Иримиа и Ван Хорн (2012) опубликовали коннектограммы, в которых исследуются корреляционные отношения между регионами и используются цифры для сравнения подходов теории графов и коннектомики. Некоторые из них были опубликованы без учета корковых показателей. Другие включают дополнительные меры, относящиеся к нейронным сетям , которые могут быть добавлены как дополнительные кольца внутрь, чтобы показать метрики теории графов , как в расширенной коннектограмме здесь:
Регионы и их сокращения
Акроним | Область в коннекограмме |
---|---|
ACgG / S | Передняя часть поясной извилины и борозды |
ACIRINS | Передний сегмент круговой борозды островка |
ALSHorp | Горизонтальная ветвь переднего сегмента боковой борозды (или трещины) |
ALSVerp | Вертикальная ветвь переднего сегмента боковой борозды (или щели) |
AngG | Угловая извилина |
AOcS | Передняя затылочная борозда и преокципитальная вырезка (височно-затылочная вырезка) |
ATrCoS | Передняя поперечная коллатеральная борозда |
CcS | Калькариновая борозда |
CgSMarp | Краевая ветвь (или часть) поясной борозды |
CoS / LinS | Медиальная затылочно-височная борозда (коллатеральная борозда) и язычная борозда |
CS | Центральная борозда (трещина Роландо) |
Cun | Куней |
FMarG / S | Лобно-краевая извилина (Вернике) и борозда |
FuG | Боковая затылочно-височная извилина ( веретенообразная извилина ) |
HG | Извилина Гешля (передняя поперечная височная извилина) |
ИнфСиРы | Нижний сегмент круговой борозды островковой доли |
InfFGOpp | Оперкулярная часть нижней лобной извилины |
InfFGOrp | Глазничная часть нижней лобной извилины |
InfFGTrip | Треугольная часть нижней лобной извилины |
InfFS | Нижняя лобная борозда |
InfOcG / S | Нижняя затылочная извилина и борозда |
InfPrCS | Нижняя часть прецентральной борозды |
IntPS / TrPS | Внутри теменная борозда (меж теменная борозда) и поперечные теменные борозды |
InfTG | Нижняя височная извилина |
InfTS | Нижняя височная борозда |
JS | Промежуточная борозда примус (Дженсена) |
LinG | Лингвальная извилина, язычная часть медиальной затылочно-височной извилины |
ЛОКТЫ | Боковая затылочно-височная борозда |
ПОДДЕРЖКА / CINS | Длинная островковая извилина и центральная островковая борозда |
LOrS | Боковая глазничная борозда |
MACgG / S | Средне-передняя часть поясной извилины и борозды |
МЕДОРС | Медиальная борозда глазницы (обонятельная борозда) |
MFG | Средняя лобная извилина |
MFS | Средняя лобная борозда |
МОКГ | Средняя затылочная извилина, латеральная затылочная извилина |
MOcS / LuS | Средняя затылочная борозда и лунная борозда |
MPosCgG / S | Средне-задняя часть поясной извилины и борозды |
MTG | Средняя височная извилина |
OcPo | Затылочный полюс |
OrG | Орбитальные извилины |
OrS | Орбитальные борозды (Н-образные борозды) |
PaCL / S | Парацентральная долька и борозда |
PaHipG | Парагиппокампальная извилина , парагиппокампальная часть медиальной затылочно-височной извилины |
PerCaS | Периклозальная борозда (S мозолистого тела) |
POcS | Теменно-затылочная борозда (или трещина) |
PoPl | Полярная плоскость верхней височной извилины |
PosCG | Постцентральная извилина |
PosCS | Постцентральная борозда |
PosDCgG | Задне-дорсальная часть поясной извилины |
PosLS | Задняя ветвь (или сегмент) боковой борозды (или трещины) |
PosTrCoS | Задняя поперечная коллатеральная борозда |
PosVCgG | Задне-вентральная часть поясной извилины (перешеек поясной извилины) |
PrCG | Прецентральная извилина |
PrCun | Precuneus |
RG | Прямая извилина (gyrus rectus) |
SbCaG | Подкаллозальная область , подкаллозальная извилина |
SbCG / S | Субцентральная извилина (центральная покрышка) и борозды |
СбОРС | Суборбитальная борозда (sulcus rostrales, надглазничная борозда) |
SbPS | Под теменная борозда |
ОБУВЬ | Короткие островные извилины |
СУМАРКА | Надмаргинальная извилина |
ПОДДЕРЖКА | Верхний сегмент круговой борозды островка |
SupFG | Верхняя лобная извилина |
SupFS | Верхняя лобная борозда |
SupOcG | Верхняя затылочная извилина |
SupPrCS | Верхняя часть прецентральной борозды |
ПОДДЕРЖКА / TROCS | Верхняя затылочная борозда и поперечная затылочная борозда |
SupPL | Верхняя теменная долька |
SupTGLp | Боковой аспект верхней височной извилины |
ПОДДЕРЖКА | Верхняя височная борозда |
TPl | Височная плоскость верхней височной извилины |
TPo | Височный полюс |
TrFPoG / S | Поперечные лобные извилины и борозды |
ТрТС | Поперечная височная борозда |
Amg | Миндалевидное тело |
Жестяная банка | Хвостатое ядро |
Бедро | Гиппокамп |
NAcc | Nucleus accumbens |
Приятель | Паллидум |
Пу | Путамен |
Tha | Таламус |
CeB | Мозжечок |
BStem | Мозговой ствол |
Смотрите также
использованная литература
дальнейшее чтение