CollecTF - CollecTF
 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | база данных экспериментально подтвержденных сайтов связывания TF |
| Организмы | бактерии |
| Связаться с нами | |
| Авторы | Кылыч и др. (2014) |
| Основное цитирование | PMID 24234444 |
| Дата выхода | 2013 |
| Доступ | |
| Формат данных | FASTA , CSV , ARFF |
| Интернет сайт |
collectf compbio |
| Скачать URL | [1] |
CollecTF - это база данных сайтов связывания факторов транскрипции в домене Bacteria.
CollecTF компилирует только экспериментально подтвержденные сайты связывания TF. Это достигается путем ручного подбора рецензируемой литературы с особым акцентом на экспериментальный процесс, используемый для идентификации сайтов связывания TF.
Записи CollecTF периодически отправляются в NCBI для интеграции в полные записи генома RefSeq в качестве дополнительных функций, повышая видимость данных и дополняя аннотации файлов RefSeq нормативной информацией. Стремясь облегчить сравнительную геномику и анализ регуляторных взаимодействий с помощью машинного обучения, в своем первоначальном выпуске CollecTF обеспечивает охват двух семейств TF ( LexA и Fur ), а также обширное представление клинически важного семейства бактерий Vibrionaceae .