В сезоне 2016-17 клуб финишировал 14-м в Tercera División, Group 8.
Уже в рамках партнерского соглашения с местным профессиональным клубом Реал Вальядолид , в августе 2020 года два клуба заключили официальную договоренность о том, что Атлетико Тордесильяс будет функционировать в качестве вспомогательной команды (ниже Реала Вальядолид Промезас ), с игроками и персоналом первой команды, предоставленными и контролируемыми Вальядолид, но Тордесильяс сохраняют идентичность (значок, форму и стадион), а также сохраняют контроль над структурой клуба в других областях.