Трепонема - Treponema
Трепонема - это род спиралевидных бактерий. Основным видом трепонем патогенов человека является Treponema pallidum , подвиды которой ответственны за такие заболевания, как сифилис , беджель и фрамбезия . Treponema carateum является причиной пинты . Treponema paraluiscuniculi связана с сифилисом у кроликов . Treponema succinifaciens была обнаружена в микробиоме кишечника традиционных сельских жителей.
Филогения
Филогения основана на выпуске 123 LTP на основе 16S рРНК проекта «All-Species Living Tree» .
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Таксономия
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI).
- ? Candidatus Treponema suis Molbak et al. 2006 г.
- ? Treponema calligyrum ♠ Noguchi
- ? Treponema carateum ♥ ( пинта - вызывающая трепонема )
- ? Treponema minutum ♦ Добелл 1912 г.
- ? Treponema pallidum ♦ (Schaudinn and Hoffmann 1905) Schaudinn 1905 г.
- Т. п. endemicum ♠ Smibert 1984 ( bejel - вызывающая Treponema )
- Т. п. pallidum ♠ (Schaudinn and Hoffmann 1905) Schaudinn 1905 ( трепонема, вызывающая сифилис )
- Т. п. pertenue ♠ Smibert 1984 ( Yaws -causing Treponema )
- ? Treponema paraluisleporis ♠ Lumeij et al. 1994 г.
- ? Treponema paraluiscuniculi ♦ (Jacobsthal 1920) Smibert 1974 г.
- ? Treponema pertenue ♦ (Castellani 1905) Castellani & Chalmers 1910 г.
- ? Treponema phagedenis ♠
- Т. п. phagedenis ♠ (Noguchi 1912) Brumpt
- Т. п. vaccae ♠ Evans et al. 2006 г.
- ? Treponema refringens ♠ (Schaudinn and Hofmann 1905) Кастеллани и Чалмерс
- ? Treponema vincentii ♠ Smibert 1984
- ? Treponema zioleckii ♠ Пикнова и др. 2008 г.
- Treponema amylovorum Wyss et al. 1997 г.
- Treponema azotonutricium Graber et al. 2004 г.
- Treponema berlinense Nordhoff et al. 2005 г.
- Treponema brennaborense Schrank et al. 1999 г.
- Treponema bryantii Stanton and Canale-Parola 1980 г.
- Treponema caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk, 2013 г.
- Treponema denticola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993 г.
- Treponema isoptericolens Dröge et al. 2008 г.
- Treponema lecithinolyticum Wyss et al. 1999 г.
- Treponema maltophilum Wyss et al. 1996 г.
-
Среда для трепонемы ♦ Umemoto et al. 1997 г.
- Т. м. bovis ♠ Evans et al. 2006 г.
- Т. м. средний ♠ Umemoto et al. 1997 г.
- Treponema parvum Wyss et al. 2001 г.
- Treponema pectinovorum Smibert and Burmeister 1983 г.
- Treponema pedis Evans et al. 2009 г.
- Treponema porcinum Nordhoff et al. 2005 г.
- Treponema primitia Graber et al. 2004 г.
- Treponema putidum Wyss et al. 2004 г.
- Treponema saccharophilum Paster and Canale-Parola 1986 г.
-
Treponema socranskii Smibert et al. 1984
- Т. с. paredis Smibert et al. 1984
- Т. с. buccale Smibert et al. 1984
- Т. с. socranskii Smibert et al. 1984
- Treponema stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk, 2013 г.
- Treponema succinifaciens Cwyk и Canale-Parola 1981 г.
- Treponema zuelzerae (ex Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 исправлено. Abt, Göker & Klenk, 2013 г.
Примечания:
♦ Типовой штамм утерян или недоступен
♠ Штаммы, обнаруженные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не перечисленные в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)
♥ Штаммы, не зарегистрированные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) ) или внесены в Список имен прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)
Виды Treponema hyodysenteriae и Treponema innocens были переклассифицированы в Serpulina hyodysenteriae и Serpulina innocens .