PRKRA - PRKRA

PRKRA
Доступные конструкции
PDB	Ортолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2DIX
Идентификаторы
Псевдонимы	PRKRA , DYT16, PACT, RAX, HSD14, белковый активатор интерферон-индуцированной протеинкиназы EIF2AK2
Внешние идентификаторы	OMIM : 603424 MGI : 1344375 HomoloGene : 2738 GeneCards : PRKRA
Расположение гена ( человек )
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	178 451 512 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	76 648 015 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция	• белок гомодимеризация активность ; • ГО: связывание белка 0001948 ; • связывание белка идентичен ; • фермента связывания ; • двухцепочечную РНК связывания ; • ГО: 0010577 фермента активатор активности ; • связывания РНК ; • связывание предварительно микроРНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма ; • мембрана ; • внутриклеточная анатомическая структура ; • нуклеоплазма ; • перинуклеарная область цитоплазмы ; • цитозоль ; • RISC-нагружающий комплекс;
Биологический процесс	• морфогенез скелетной системы ; • ответ на вирус ; • морфогенез наружного уха ; • процессинг пре-миРНК ; • фосфорилирование белков ; • иммунный ответ ; • морфогенез среднего уха ; • клеточный ответ на окислительный стресс ; • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути ; • негативная регуляция пролиферации клеточной популяции ; • продукция miRNAs, участвующих в подавлении генов с помощью miRNA ; • GO: 0048554 положительная регуляция каталитической активности ; • стабилизация белков ; • метаболический процесс miRNA ; • производство siRNA, участвующих в РНК-интерференции ; • подавление гена с помощью RNA ; • GO: 0022415 вирусный процесс ; • развитие уха;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
	8575
	23992
	ENSG00000180228
	ENSMUSG00000002731
	O75569
	Q9WTX2
	NM_001139517 ; NM_001139518 ; NM_001316362 ; NM_003690
	NM_011871
	NP_001132989 ; NP_001132990 ; NP_001303291 ; NP_003681
	NP_036001
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Протеинкиназы, интерферон-индуцируемого двухцепочечный РНК зависимый активатора , также известный как интерферон-индуцируемый двухцепочечная РНК-зависимая протеинкиназа активатор с или Р rotein АКТ ivator из интерферона-индуцированной протеинкиназы ( ПАКТ ) представляет собой белка , который у человека кодируется по PRKRA гена . ПДЦО heterodimerizes с и активирует протеинкиназы R . Мутации PRKRA связаны с редкой формой паркинсонической дистонии.

использованная литература

дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Петерс Г.А., Хартманн Р., Цинь Дж. И др. (2001). «Модульная структура PACT: отдельные домены для связывания и активации PKR» . Mol Cell Biol . 21 (6): 1908–20. DOI : 10.1128 / MCB.21.6.1908-1920.2001 . PMC 86773 . PMID 11238927 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Genome Res . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . EMBO Rep . 1 (3): 287–92. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Хорнг Т., Бартон Г.М., Меджитов Р. (2001). «TIRAP: адаптерная молекула в пути передачи сигналов Toll». Nat. Иммунол . 2 (9): 835–41. DOI : 10.1038 / ni0901-835 . PMID 11526399 . S2CID 7296195 .
Хуанг X, Хатчинс Б., Патель Р.К. (2002). «С-концевой, третий консервативный мотив белкового активатора PACT играет важную роль в активации двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы (PKR)» . Biochem. Дж . 366 (Pt 1): 175–86. DOI : 10.1042 / BJ20020204 . PMC 1222748 . PMID 11985496 .
Петерс Г.А., Кху Д., Мор И., Сен Г.К. (2002). «Ингибирование опосредованной PACT активации PKR белком Us11 вируса простого герпеса 1 типа» . J. Virol . 76 (21): 11054–64. DOI : 10.1128 / JVI.76.21.11054-11064.2002 . PMC 136652 . PMID 12368348 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ян М., Ито Т., Май WS (2003). «Новая роль RAX, клеточного активатора PKR, в синергетическом стимулировании экспрессии большого Т-антиген-зависимого гена SV40» . J. Biol. Chem . 278 (40): 38325–32. DOI : 10.1074 / jbc.M303420200 . PMID 12874289 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Беннетт Р.Л., Блэлок В.Л., Мэй В.С. (2004). «Фосфорилирование серина 18 RAX, активатора PKR, необходимо для активации PKR и последующего ингибирования трансляции» . J. Biol. Chem . 279 (41): 42687–93. DOI : 10.1074 / jbc.M403321200 . PMID 15299031 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Хиллиер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Создание и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Bibcode : 2005Natur.434..724H . DOI : 10,1038 / природа03466 . PMID 15815621 .
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957–68. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Петерс Г.А., Ли С., Сен Г.К. (2006). «Фосфорилирование специфических остатков серина в PKR-активационном домене PACT важно для его способности опосредовать апоптоз» . J Biol Chem . 281 (46): 35129–36. DOI : 10.1074 / jbc.M607714200 . PMID 16982605 .
Rowe TM, Rizzi M, Hirose K, Peters GA, et al. (2006). «Роль двухцепочечного РНК-связывающего белка PACT в развитии уха и слухе мышей» . Proc Natl Acad Sci USA . 103 (15): 5823–8. Bibcode : 2006PNAS..103.5823R . DOI : 10.1073 / pnas.0601287103 . PMC 1458657 . PMID 16571658 .
Ли С., Петерс Г.А., Динг К. и др. (2006). «Молекулярная основа активации PKR с помощью PACT или дцРНК» . Proc Natl Acad Sci USA . 103 (26): 10005–10. Bibcode : 2006PNAS..10310005L . DOI : 10.1073 / pnas.0602317103 . PMC 1502496 . PMID 16785445 .
Ли Y, Hur I, Park SY и др. (2006). «Роль PACT в пути молчания РНК» . EMBO J . 25 (3): 522–32. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600942 . PMC 1383527 . PMID 16424907 .
Беннетт Р.Л., Блэлок В.Л., Абтахи Д.М. и др. (2006). «RAX, активатор PKR, сенсибилизирует клетки к воспалительным цитокинам, отмене сыворотки, химиотерапии и вирусным инфекциям» . Кровь . 108 (3): 821–9. DOI : 10.1182 / кровь-2005-11-006817 . PMC 1617065 . PMID 16861340 .
Петерс Г.А., Сикрист Д.Д., Кери Р.А. и др. (2009). «Двухцепочечный РНК-связывающий белок, PACT, необходим для постнатальной пролиферации передней доли гипофиза» . Proc Natl Acad Sci USA . 106 (26): 10696–701. Bibcode : 2009PNAS..10610696P . DOI : 10.1073 / pnas.0900735106 . PMC 2705576 . PMID 19541653 .

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Languages

In other projects

PRKRA - PRKRA

использованная литература

дальнейшее чтение