Лиссавирус -Lyssavirus
| Лиссавирус | |
|---|---|
|
|
| Цветной трансмиссионные электронный микроскоп из австралийского Lyssavirus летучего мышея . Пулеподобные объекты - это вирионы, и некоторые из них отпочковываются из клетки. | |
Классификация вирусов 
|
|
| (без рейтинга): | Вирус |
| Царство : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Класс: | Monjiviricetes |
| Порядок: | Mononegavirales |
| Семья: | Rhabdoviridae |
| Род: | Лиссавирус |
| Разновидность | |
|
|
Lyssavirus (от греческого λύσσα lyssa «ярость, ярость, бешенство» и латинского vīrus ) - это род РНК-вирусов в семействе Rhabdoviridae , отряд Mononegavirales . Млекопитающие, включая человека, могут служить естественными хозяевами. Род Lyssavirus включает вирус бешенства, традиционно связанный с одноименным заболеванием .
Таксономия
Вирусология
Состав
Лиссавирионы имеют обволакивающую форму и имеют форму пули. Эти вирионы имеют ширину около 75 нм и длину 180 нм. Лиссавирионы обладают спиральной симметрией, поэтому их инфекционные частицы имеют приблизительно цилиндрическую форму. Это типично для вирусов, поражающих растения. Вирионы вирусов, заражающих человека, чаще имеют кубическую симметрию и принимают форму, напоминающую правильные многогранники .
Структура состоит из внешней оболочки с шипами , средней области, состоящей из матричного белка M, и внутренней области рибонуклеокапсидного комплекса, состоящей из генома, связанного с другими белками.
Геном
Геномы лиссавируса состоят из одноцепочечной молекулы РНК с отрицательным смыслом, которая кодирует пять вирусных белков: полимеразу L, матричный белок M, фосфопротеин P, нуклеопротеин N и гликопротеин G. Геномы линейны, длиной около 11 килобайт.
На основании недавних филогенетических данных лиссавирусы были разделены на семь основных видов . Кроме того, недавно были обнаружены еще пять видов: вирус летучих мышей Западного Кавказа, вирус Араван, вирус Худжанда, вирус Иркут и вирус летучих мышей Шимони. Род лиссавирусов можно разделить на четыре филогруппы на основе гомологии последовательностей ДНК. Филогруппа I включает вирусы, такие как вирус бешенства, вирус Duvenhage, лиссавирус европейских летучих мышей типов 1 и 2, австралийский лиссавирус летучих мышей, вирус Худжанда, лиссавирус летучих мышей Бокело, вирус Иркут и вирус Араван. Филогруппа II содержит вирус летучих мышей Лагоса, вирус Мокола и вирус летучих мышей Шимони. Лиссавирус западно-кавказских летучих мышей - единственный вирус, входящий в состав филогруппы III. Лиссавирус Ikoma и лиссавирус летучих мышей Lleida являются примерами филогруппы IV. Лиссавирус западно-кавказских летучих мышей был классифицирован в рамках своей собственной филогруппы, поскольку это наиболее дивергентный из обнаруженных лиссавирусов.
| Род | Состав | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Лиссавирус | Пулевидный | Окутанный | Линейный | Одночастный |
Эволюция
Фитогенетические исследования показывают, что первоначальными хозяевами этих вирусов были летучие мыши. Большое антигенное разнообразие лизавирусов из Африки привело к предположению, что Африка была источником этих вирусов. Исследование 153 вирусов, собранных в период с 1956 по 2015 год в различных географических точках, показало, что эти вирусы имеют палеарктическое происхождение (вероятность 85%). Оценки дат (вероятность 95%) для самого недавнего общего предка были очень широкими - от 3 995 до 166 820 лет до настоящего времени - что говорит о том, что в этой области предстоит проделать дополнительную работу. Хотя летучие мыши эволюционировали в Палеарктике, их происхождение предшествовало лиссавирусам на миллионы лет, что свидетельствует против их совместного видообразования. Скорость эволюции гена N в линии Africa 2 была оценена как 3,75 × 10 -3 замен на сайт в год. Этот показатель аналогичен показателям других РНК-вирусов.
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусных гликопротеинов G к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз . Репликация следует модели репликации вируса с отрицательной цепью РНК. Транскрипция вируса с отрицательной цепочкой РНК с использованием полимеразного заикания является методом транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет почкования и движения вируса по канальцам. Дикие млекопитающие, особенно летучие мыши и некоторые плотоядные животные, служат естественными хозяевами. Пути передачи обычно через укушенные раны.
| Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Лиссавирус | летучие мыши, землеройки Crocidura и некоторые плотоядные животные | Нейроны | Клатрин-опосредованный эндоцитоз | Почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Укушенные раны |
Тестирование
По состоянию на 2018 год тест на прямые флуоресцентные антитела (DFA) по-прежнему является золотым стандартом для выявления лиссавирусной инфекции. Начиная с нового тысячелетия, тесты ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) были разработаны для лечения бешенства, но использовались только в качестве подтверждающего теста. Тесты на основе ПЦР в реальном времени, которые обладают более высокой чувствительностью и объективными диагностическими порогами и позволяют хранить образцы при комнатной температуре, были многообещающими с 2005 года, но требуют установки ПЦР в реальном времени и квалифицированных специалистов с опытом молекулярной диагностики. Согласно международной оценке, один анализ TaqMan LN34 может обнаруживать Lyssavirus с высокой чувствительностью (99,90%) по всему роду и высокой специфичностью (99,68%) по сравнению с тестом DFA. По возможности, он станет основным посмертным диагностическим тестом на бешенство.
Эпидемиология
Классический вирус бешенства распространен во всем мире и может переноситься любым теплокровным млекопитающим. Другие лиссавирусы имеют гораздо меньшее разнообразие носителей. Только избранные хозяева могут нести каждый из этих вирусных видов . Кроме того, эти другие виды характерны только для определенной географической области. Известно, что летучие мыши являются животными- переносчиками всех идентифицированных лиссавирусов, кроме вируса Мокола .
Смотрите также
использованная литература
дальнейшее чтение
- Ботвинкин А.Д., Полещук Е.М., Кузьмин И.В., Борисова Т.И., Газарян С.В., Ягер П., Руппрехт CE (декабрь 2003 г.). «Новые лиссавирусы, выделенные от летучих мышей в России» . Возникающие инфекционные заболевания . 9 (12): 1623–1625. DOI : 10.3201 / eid0912.030374 . PMC 3034350 . PMID 14720408 .
- Арай Ю.Т., Кузьмин И.В., Камеока Ю., Ботвинкин А.Д. (март 2003 г.). «Новый генотип лиссавируса малой ушастой летучей мыши (Myotis blythi), Кыргызстан» . Возникающие инфекционные заболевания . 9 (3): 333–337. DOI : 10.3201 / eid0903.020252 . PMC 2958534 . PMID 12643828 .
- Всемирная организация здравоохранения (2005 г.). Консультации экспертов ВОЗ по бешенству (PDF) . Серия технических отчетов ВОЗ. Женева, Швейцария: Всемирная организация здравоохранения. ISBN 978-92-4-120931-1.