Гипервариабельная область - Hypervariable region

Гипервариабельная область ( HVR ) представляет собой расположение в пределах ядерной ДНК или D-петле в митохондриальной ДНК , в которой пар оснований из нуклеотидов повторить (в случае ядерной ДНК) , либо замены (в случае митохондриальной ДНК). Изменения или повторы в гипервариабельной области очень полиморфны .

Митохондриальный

Митохондриальный геном человека показывает гипервариабельные области от I до III (зеленые прямоугольники), расположенные в контрольной области (CR; серый прямоугольник).

В генеалогическом тестировании митохондриальной ДНК человека используются две гипервариабельные области митохондрий . HVR1 считается областью «низкого разрешения», а HVR2 считается областью «высокого разрешения». Получение тестов ДНК HVR1 и HVR2 может помочь определить гаплогруппу . В пересмотренной Кембриджской эталонной последовательности митогенома человека наиболее вариабельные сайты HVR1 пронумерованы 16024-16383 (эта подпоследовательность называется HVR-I), а наиболее вариабельные сайты HVR2 пронумерованы 57-372 ( т. Е. HVR-II. ) и 438-574 ( т.е. HVR-III).

У некоторых костистых рыб , например у некоторых Protacanthopterygii и Gadidae , митохондриальная контролирующая область развивается очень медленно. Даже функциональные митохондриальные гены быстрее и свободнее накапливают мутации. Неизвестно, распространены ли такие гиповариабельные контрольные области более широко. У аю ( Plecoglossus altivelis ), восточноазиатского протакантоптерига, частота мутаций в контрольной области заметно не снижена, но различия в последовательностях между подвидами в контрольной области намного ниже, чем где-либо еще. Это явление в настоящее время полностью не поддается объяснению.

Антитела

В антителах гипервариабельные области образуют антигенсвязывающий сайт и обнаруживаются как на легких, так и на тяжелых цепях . Они также способствуют специфичности каждого антитела. В вариабельной области , 3 Н _V сегментов каждой тяжелой или легкой цепи складываются вместе на N-конце , чтобы сформировать антигенсвязывающий карман.

Смотрите также

• Кембриджская эталонная последовательность
• Генеалогический ДНК-тест
• Гаплогруппа митохондриальной ДНК человека
• контрольная область мтДНК

использованная литература

внешние ссылки

• Гипервариабельный + регион в Национальной медицинской библиотеке США по предметным заголовкам по медицинским предметам (MeSH)
• ДНК: судебные и юридические применения, объяснение гипервариабельных областей