FYVE домен - FYVE domain
| FYVE цинковый палец | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Димер раннего эндосомного антигена 1 ( EEA1 ) с липидами.
| |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | FYVE | ||||||||
| Pfam | PF01363 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000306 | ||||||||
| ПРОФИЛЬ | PDOC50178 | ||||||||
| SCOP2 | 1vfy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM суперсемейство | 59 | ||||||||
| Белок OPM | 1vfy | ||||||||
| CDD | cd00065 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен цинкового пальца FYVE назван в честь четырех богатых цистеином белков : F ab 1 (дрожжевой ортолог PIKfyve ), Y OTB, V ac 1 (белок транспорта везикул) и E EA1 , в котором он был обнаружен. . Домены FYVE связывают фосфатидилинозитол-3-фосфат в зависимости от координации его ионов металла и основных аминокислот. Домен FYVE встраивается в клеточные мембраны в зависимости от pH. Домен FYVE связан с сортировкой вакуолярных белков и функцией эндосом .
Состав
Домен FYVE состоит из двух маленьких бета-шпилек (или цинковых суставов), за которыми следует альфа-спираль. Палец FYVE связывает два иона цинка . Палец FYVE имеет восемь потенциальных цинк-координирующих положений цистеина и характеризуется наличием основных аминокислот вокруг цистеина. Многие члены этого семейства также включают два гистидина в мотив последовательности:
Палец FYVE структурно похож на домен RING и палец PHD .
Примеры
Ниже приводится список белков человека, содержащих этот домен:
- ANKFY1 , EEA1 , FGD1 , FGD2 , FGD3 , FGD4 , FGD5 , FGD6 , FYCO1 , HGS , MTMR3 , MTMR4 , PIKFYVE , PLEKHF1 , PLEKHF2
- RUFY1 , RUFY2 , WDF3 , WDFY1 , WDFY2 , WDFY3 , ZFYVE1 , ZFYVE16 , ZFYVE19 , ZFYVE20 , ZFYVE21 , ZFYVE26 , ZFYVE27 , ZFYVE28 , ZFYVE9
Рекомендации
дальнейшее чтение
- Стенмарк Х., Осланд Р., То Б. Х., Д'Арриго А. (сентябрь 1996 г.). «Эндосомная локализация аутоантигена EEA1 опосредуется цинк-связывающим пальцем FYVE» . J. Biol. Chem . 271 (39): 24048–54. DOI : 10.1074 / jbc.271.39.24048 . PMID 8798641 .
- Стенмарк Х., Осланд Р. (декабрь 1999 г.). «Белки FYVE-finger - эффекторы липида инозита». J. Cell Sci . 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636 .