Карбоксипептидаза - Carboxypeptidase

Карбоксипептидаза А из поджелудочной железы крупного рогатого скота

Карбоксипептидаза ( номер EC 3.4.16 - 3.4.18) представляет собой протеазный фермент, который гидролизует (расщепляет) пептидную связь на карбоксиконцевом (С-конце) конце белка или пептида . В этом отличие от аминопептидаз , которые расщепляют пептидные связи на N-конце белков. Люди, животные, бактерии и растения содержат несколько типов карбоксипептидаз, которые выполняют разнообразные функции, от катаболизма до созревания белка.

Механизм

Механизм производства карбоксипептидазы заключается в том, что вода, координирующая субстрат, заменяется субстратом из карбонильных (C = O) групп.

Карбоксипептидаза-ангидридный механизм.png

Функции

Первыми изучаемыми карбоксипептидазами были те, которые участвуют в переваривании пищи (карбоксипептидазы поджелудочной железы A1, A2 и B). Однако большинство известных карбоксипептидаз не участвует в катаболизме ; они помогают созревать белкам (например, посттрансляционная модификация ) или регулируют биологические процессы. Например, для биосинтеза нейроэндокринных пептидов, таких как инсулин, требуется карбоксипептидаза. Карбоксипептидазы также участвуют в свертывании крови , производстве факторов роста , заживлении ран , воспроизводстве и многих других процессах.

Классификации

По механизму активного сайта

Карбоксипептидазы обычно классифицируются в одно из нескольких семейств на основе механизма их активного сайта.

  • Ферменты, которые используют металл в активном центре, называются «металлокарбоксипептидазами» (номер ЕС 3.4.17).
  • Другие карбоксипептидазы, в которых используются остатки серина в активном центре , называются «серинкарбоксипептидазами» (номер EC 3.4.16).
  • Те , которые используют активный сайт цистеин называют «цистеин карбоксипептидазой» (или « тиоловой карбоксипептидазой») (EC номер 3.4.18).

Эти названия не относятся к селективности расщепляемой аминокислоты.

По предпочтению субстрата

Другая система классификации карбоксипептидаз касается их предпочтения в отношении субстрата.

Металлокарбоксипептидаза, которая отщепляет С-концевой глутамат от пептида N-ацетил-L-аспартил-L-глутамата, называется « глутаматкарбоксипептидаза ».

Серинкарбоксипептидаза, которая отщепляет C-концевой остаток от пептидов, содержащих последовательность -Pro-Xaa (Pro - пролин, Xaa - любая аминокислота на C-конце пептида), называется « пролилкарбоксипептидазой ».

Активация

Некоторые, но не все карбоксипептидазы изначально продуцируются в неактивной форме; эта форма-предшественник называется прокарбоксипептидазой . В случае карбоксипептидазы А поджелудочной железы неактивная форма зимогена - прокарбоксипептидаза А - превращается в свою активную форму - карбоксипептидазу А - ферментом трипсином . Этот механизм гарантирует, что клетки, в которых продуцируется про-карбоксипептидаза А, сами не перевариваются.

Смотрите также

использованная литература

внешние ссылки