Буркхольдерия -Burkholderia
Burkholderia | |
---|---|
Колонии B. pseudomallei на чашке с кровяным агаром . | |
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Порядок: | |
Семья: | |
Род: |
Burkholderia
Yabuuchi et al . 1993 г.
|
Типовой вид | |
Burkholderia cepacia (Паллерони и Холмс, 1981) Yabuuchi et al . 1993 г.
|
|
Разновидность | |
См. Текст. |
Burkholderia является родом протеобактерий которого патогенного члены включают Burkholderia cepacia сложного , который атакует человек и Burkholderia mallei , ответственный за сап , заболеваниекоторое происходитосновном лошадь и связанныеними животными; Burkholderia pseudomallei , возбудитель мелиоидоза ; и Burkholderia cepacia , важный патоген легочных инфекций у людей с муковисцидозом (CF). Вид Burkholderia также встречается в морской среде. SI Paul et al. (2021) выделены и охарактеризованы Burkholderia cepacia из морских губок из острова Святого Мартина в Бенгальском заливе , Бангладеш .
Burkholderia (ранее часть Pseudomonas ) название рода относится к группе практически повсеместного грамотрицательных , облигатно аэробным , стержнеобразных бактерий, которые подвижны с помощью одного или нескольких полярных жгутиков , за исключением Burkholderia mallei , что неподвижные . Члены этого рода не образуют оболочек или протезов и могут использовать поли-бета-гидроксибутират (ПОБ) для роста. В этот род входят патогены как животных, так и растений , а также некоторые экологически важные виды. В частности, B. xenovorans (ранее называвшийся Pseudomonas cepacia, затем B. cepacia и B. фунгорум ) известен своей положительной каталазой (поражает пациентов с хронической гранулематозной болезнью ) и своей способностью разлагать хлорорганические пестициды и полихлорированные бифенилы . Мотив РНК анти-hemB с консервативной структурой РНК встречается у всех известных бактерий этого рода.
Из-за их устойчивости к антибиотикам и высокой смертности от связанных с ними заболеваний B. mallei и B. pseudomallei считаются потенциальными боевыми биологическими агентами, нацеленными на домашний скот и людей.
История
Род был назван в честь Уолтера Х. Буркхолдера , патолога растений Корнельского университета . Первые виды, помещенные в этот род, были перенесены от Pseudomonas на основании различных биохимических тестов.
До недавнего времени род Burkholderia включал все виды Paraburkholderia . Однако род Paraburkholderia филогенетически отличается, и его можно отличить от всех видов Burkholderia на основе молекулярных сигнатур, которые уникально обнаруживаются для каждого рода.
Таксономия
Burkholderia виды образуют монофилетическую группу в пределах Burkholderiales порядка Betaproteobacteria . В настоящее время 48 правомерно названных видов можно отличить от родственных родов (например, Paraburkholderia ) и всех других бактерий по консервативным индексам сигнатур в различных белках. Эти индели представляют исключительную общую родословную, разделяемую всеми видами Burkholderia .
Род имеет три отдельных монофилетических кластера. Одна группа состоит из всех видов, принадлежащих к комплексу Burkholderia cepacia , другая клада включает B. pseudomallei и близкородственные виды, а последняя клада включает большинство фитогенных видов в пределах рода, включая B. glumae и B. gladioli . Сохраненные индели сигнатуры специфичны для каждой из этих подгрупп внутри рода, что помогает в разграничении членов этого чрезвычайно большого и разнообразного рода.
Исследовать
В последнее время исследования видов Burkholderia изучили ряд тем и характеристик, включая метаболомный ответ на антибиотики, контактно-зависимые взаимодействия между бактериальными сообществами и геномный потенциал для получения полезных продуктов.
В Burkholderia видах, некоторые антибиотики , такие как триметоприт , как были показаны , чтобы вызвать и активируют большое количество метабола , вызывая более 100 молчащих вторичных кластеров генов метаболита в Burkholderia thailandensis . Эти глобальные активаторы можно использовать в качестве источника исследования того, как метаболомы патогенных видов бактерий реагируют на стресс антибиотиками и как виды бактерий могут варьироваться в ответ на них. Было показано , что тесно связано муковисцидоз -associated Burkholderia видов реагировать на триметопримет с различными уровнями экспрессии различных вторичных метаболитов , выделяя персонифицированный характер метаболомики в связанных бактериальных штаммах.
Исследования, сфокусированные на межбактериальной передаче сигналов с использованием Burkholderia , показали, что контактно-зависимое ингибирование роста играет важную роль в опосредовании межклеточной коммуникации, в частности, у B. thailandensis . При этом взаимодействии клетки выделяют белковые токсины в окружающую среду, и только те, у которых есть соответствующий защитный белок (обычно бактерии того же штамма), не будут тормозить рост или погибнуть. Кроме того, клетки-реципиенты, которые имеют соответствующий белок, затем претерпевают изменения в экспрессии генов и фенотипе, что способствует формированию сообщества в форме биопленок . Это происходит, даже если клетка-реципиент не принадлежит к тому же штамму бактерий, что подчеркивает важность этой системы. Гены, кодирующие белковые токсины и остальную часть системы контактно-зависимого ингибирования, могут стать мобильными в форме транспозона, который может переноситься между клетками и имеет решающее значение для коммунального аспекта системы. Таким образом, контакт-зависимая передача сигналов играет важную роль в самопознании бактерий и формировании сообщества.
Было показано, что виды Burkholderia являются потенциальным источником полезных продуктов, таких как противомикробные препараты и биосурфактанты . Наряду с соответствующим родом Pseudomonas , Burkholderia может синтезировать конкретный класс биосурфактанта называемых rhamnolipids . Рамнолипиды, синтезированные Burkholderia, имеют различные химические характеристики (по сравнению с синтезированными Pseudomonas ) и, таким образом, имеют потенциал для новых применений.
Разновидность
Список видов:
- Burkholderia alpina
- Буркхолдерия амбифария
- Burkholderia anthina
- Burkholderia arboris
- Burkholderia cenocepacia
- Burkholderia cepacia
- Burkholderia contaminans
- Burkholderia diffusa
- Burkholderia dolosa
- Буркхолдерия гладиолусов
- Burkholderia glumae
- Burkholderia humptydooensis
- Burkholderia lata
- Burkholderia latens
- Burkholderia mallei
- Burkholderia Metallica
- Burkholderia multivorans
- Burkholderia oklahomensis
- Burkholderia plantarii
- Burkholderia pseudomallei
- Burkholderia pseudomultivorans
- Burkholderia puraquae
- Burkholderia pyrrocinia
- Буркхолдерия семенная
- Burkholderia singaporensis
- Burkholderia singularis
- Буркхолдерия стабилизированная
- Burkholderia stagnalis
- Burkholderia Territorii
- Burkholderia thailandensis
- Burkholderia ubonensis
- Burkholderia vietnamiensis
Смотрите также
использованная литература
внешние ссылки
- Геномы Burkholderia и соответствующая информация в PATRIC , Ресурсном центре биоинформатики, финансируемом NIAID
- Pathema- Burkholderia Resource
- База данных генома Burkholderia