Bradyrhizobium japonicum -Bradyrhizobium japonicum
Bradyrhizobium japonicum | |
---|---|
Штамм Bradyrhizobium japonicum USDA 110 на чашке с агаром | |
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Класс: | |
Порядок: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: |
B. japonicum
|
Биномиальное имя | |
Bradyrhizobium japonicum |
|
Синонимы | |
Rhizobium japonicum Buchanan 1926 |
Bradyrhizobium japonicum является однимвидов бобовых культур - корневой клубеньковых , microsymbiotic азотфиксирующих бактерий. Этот вид является одним из многих грамотрицательных , палочковидных бактерий обычно называют ризобии . В рамках этой широкой классификации, состоящей из трех групп, таксономические исследования с использованием секвенирования ДНК показывают, что B. japonicum принадлежит кгруппе гомологии II.
Использует
сельское хозяйство
B. japonicum добавляют в семена бобовых для повышения урожайности , особенно в районах, где бактерия не является местной (например, в почвах Арканзаса ). Часто Посевной будет привязан к семенам до посева с использованием раствора сахара.
Исследовать
Штамм B. japonicum , USDA110, используется в качестве модельного организма с 1957 года. Он широко используется для изучения молекулярной генетики , физиологии растений и экологии растений из-за его относительно более высокой симбиотической активности по связыванию азота с соей (т.е. к другим видам ризобий). Его весь геном был секвенирован в 2002 году, и было обнаружено, что этот вид имеет одну кольцевую хромосому с 9 105 828 парами оснований .
Метаболизм
B. japonicum способен разрушать катехин с образованием флороглюцинкарбоновой кислоты , далее декарбоксилированной до флороглюцина , который дегидроксилируется до резорцина и гидроксихинола .
B. japonicum обладает геном nosRZDFYLX , который способствует денитрификации и имеет две каталитические субъединицы - Cu-a и Cu-z (с несколькими остатками гистидина). Он управляет каскадом экспрессии, который может определять градиенты кислорода, называемый «FixJ-FixK2-FixK1». FixJ положительно регулирует FixK2, который активирует гены азотного дыхания, а также FixK1. Мутанты FixK1 не могут дышать от азота из-за дефектной кататиловой субъединицы меди (Cu-z) в nosRZDFYLX .
Генетическая трансформация
Естественная генетическая трансформация у бактерий - это половой процесс, включающий передачу ДНК от одной клетки к другой через промежуточную среду и интеграцию донорной последовательности в геном реципиента путем гомологичной рекомбинации . Клетки B. japonicum способны подвергаться трансформации. Они становятся компетентными для захвата ДНК на поздней стадии регистрации.