Бета-пептид - Beta-peptide
β-пептиды - это пептиды, полученные из β-аминокислот. Исходной β-аминокислотой является H 2 NCH 2 CH 2 CO 2 H, но в большинстве примеров присутствуют заместители вместо одной или нескольких связей CH. Единственная обычная встречающаяся в природе β-аминокислота - это β-аланин . β-пептиды в природе не встречаются. Антибиотики на основе β-пептидов исследуются как способы избежать устойчивости к антибиотикам . Ранние исследования в этой области были опубликованы в 1996 году группой Дитера Зеебаха и Самуэля Геллмана.
Синтез
Существуют два основных типа β-пептидов: те, у которых есть органический остаток (R) рядом с амином, называются β 3 -пептидами, а те, которые имеют положение рядом с карбонильной группой, называются β 2 -пептидами.
β-Аминокислоты были получены многими способами, в том числе на основе синтеза Арндта-Эйстерта .
Вторичная структура
Поскольку их скелет длиннее, чем у нормальных пептидов , β-пептиды образуют несопоставимые вторичные структуры . В алкильных заместителях на оба а и р позиций в р аминокислот выступают за Гошами конформации о связи между альфа-углеродом и бета-углеродом. Это также влияет на термодинамическую устойчивость конструкции.
Сообщалось о многих типах спиральных структур, состоящих из β-пептидов. Эти типы конформации различаются количеством атомов в кольце с водородными связями , которое образуется в растворе; Сообщалось о 8-спиралях, 10-спиралях, 12-спиралях, 14-спиралях и 10/12 спиралях. Вообще говоря, β-пептиды образуют более стабильную спираль, чем α-пептиды.
Клинический потенциал
β-пептиды устойчивы к протеолитической деградации in vitro и in vivo , что является потенциальным преимуществом перед природными пептидами. β-Пептиды использовались для имитации природных пептидных антибиотиков, таких как магаинины , которые обладают высокой эффективностью, но их трудно использовать в качестве лекарств, поскольку они разлагаются протеолитическими ферментами.
Список
Существует 8 бета-форм: формы аланина, лейцина, лизина, аргинина, глутамата, глутамина, фенилаланина, тирозина. Аспарагиновая кислота считается как бета-, так и альфа-формами, хотя бета-форма содержится в микроцистинах .