Аламетицин - Alamethicin

Аламетицин

Имена
Название ИЮПАК N - ацетил-2-methylalanyl- L пролил-2-methylalanyl- л аланил-2-methylalanyl- L -аланил- L -glutaminyl-2-methylalanyl- л -valyl-2-methylalanylglycyl- л -leucyl-2- methylalanyl- L -prolyl- L -valyl-2-methylalanyl-2-methylalanyl- L -α-глутамил N 1 - [(1 S ) -1-бензил-2-гидроксиэтил] - L -glutamamide
Идентификаторы
Количество CAS
3D модель ( JSmol )
ЧЭМБЛ
ChemSpider
ECHA InfoCard	100.121.626
PubChem CID
UNII
Панель управления CompTox ( EPA )
ИнЧИ InChI = 1S / C92H150N22O25 / c1-47 (2) 43-58 (72 (127) 108-92 (24,25) 84 (139) 113-41-29-33-59 (113) 73 (128) 103- 65 (48 (3) 4) 75 (130) 111-90 (20,21) 82 (137) 112-89 (18,19) 80 (135) 102-56 (37-40-64 (120) 121) 70 (125) 101-55 (35-38-61 (93) 117) 69 (124) 98-54 (46-115) 44-53-31-27-26-28-32-53) 99-63 ( 119) 45-95-77 (132) 85 (10,11) 110-76 (131) 66 (49 (5) 6) 104-81 (136) 88 (16,17) 107-71 (126) 57 ( 36-39-62 (94) 118) 100-67 (122) 50 (7) 96-78 (133) 86 (12,13) ​​106-68 (123) 51 (8) 97-79 (134) 87 ( 14,15) 109-74 (129) 60-34-30-42-114 (60) 83 (138) 91 (22,23) 105-52 (9) 116 / ч 26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H, 29-30,33-46H2,1-25H3, (H2,93,117) (H2,94,118) (H, 95,132) (H, 96,133) (H, 97,134) (H , 98,124) (H, 99,119) (H, 100,122) (H, 101,125) (H, 102,135) (H, 103,128) (H, 104,136) (H, 105,116) (H, 106,123) (H, 107,126) (H , 108,127) (H, 109,129) (H, 110,131) (H, 111,130) (H, 112,137) (H, 120,121) / t50-, 51-, 54-, 55-, 56-, 57-, 58-, 59-, 60-, 65-, 66- / м0 / с1 Y Ключ: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNSA-N Y InChI = 1 / C92H150N22O25 / c1-47 (2) 43-58 (72 (127) 108-92 (24,25) 84 (139) 113-41-29-33-59 (113) 73 (128) 103- 65 (48 (3) 4) 75 (130) 111-90 (20,21) 82 (137) 112-89 (18,19) 80 (135) 102-56 (37-40-64 (120) 121) 70 (125) 101-55 (35-38-61 (93) 117) 69 (124) 98-54 (46-115) 44-53-31-27-26-28-32-53) 99-63 ( 119) 45-95-77 (132) 85 (10,11) 110-76 (131) 66 (49 (5) 6) 104-81 (136) 88 (16,17) 107-71 (126) 57 ( 36-39-62 (94) 118) 100-67 (122) 50 (7) 96-78 (133) 86 (12,13) ​​106-68 (123) 51 (8) 97-79 (134) 87 ( 14,15) 109-74 (129) 60-34-30-42-114 (60) 83 (138) 91 (22,23) 105-52 (9) 116 / ч 26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H, 29-30,33-46H2,1-25H3, (H2,93,117) (H2,94,118) (H, 95,132) (H, 96,133) (H, 97,134) (H , 98,124) (H, 99,119) (H, 100,122) (H, 101,125) (H, 102,135) (H, 103,128) (H, 104,136) (H, 105,116) (H, 106,123) (H, 107,126) (H , 108,127) (H, 109,129) (H, 110,131) (H, 111,130) (H, 112,137) (H, 120,121) / t50-, 51-, 54-, 55-, 56-, 57-, 58-, 59-, 60-, 65-, 66- / м0 / с1 Ключ: LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNBC
Улыбки CC (C) C [C @@ H] (C (= O) NC (C) (C) C (= O) N1CCC [C @ H] 1C (= O) N [C @@ H] (C ( C) C) C (= O) NC (C) (C) C (= O) NC (C) (C) C (= O) N [C @@ H] (CCC (= O) O) C ( = O) N [C @@ H] (CCC (= O) N) C (= O) N [C @@ H] (CC2 = CC = CC = C2) CO) NC (= O) ЧПУ (= O ) C (C) (C) NC (= O) [C @ H] (C (C) C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) [C @ H] (CCC ( = O) N) NC (= O) [C @ H] (C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) [C @ H] (C) NC (= O) C ( C) (C) NC (= O) [C @@ H] 3CCCN3C (= O) C (C) (C) NC (= O) C CC (C) CC (C (= O) NC (C) (C) C (= O) N1CCCC1C (= O) NC (C (C) C) C (= O) NC (C) (C) C ( = O) NC (C) (C) C (= O) NC (CCC (= O) O) C (= O) NC (CCC (= O) N) C (= O) NC (Cc2ccccc2) CO) NC (= O) ЧПУ (= O) C (C) (C) NC (= O) C (C (C) C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) C (CCC ( = O) N) NC (= O) C (C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) C (C) NC (= O) C (C) (C) NC (= O) C3CCCN3C (= O) C (C) (C) NC (= O) C
Характеристики
Химическая формула	С 92 H 150 N 22 O 25
Молярная масса	1964,31 г / моль
Появление	Не совсем белое твердое вещество
Температура плавления	От 255 до 270 ° C (от 491 до 518 ° F; от 528 до 543 K)
Растворимость в воде	Нерастворимый
Растворимость в ДМСО , метаноле , этаноле	Растворимый
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
N проверить  ( что есть   ?) YN
Ссылки на инфобоксы

Аламетицин - каналообразующий пептидный антибиотик , продуцируемый грибом Trichoderma viride . Он относится к пептидам пептаибола, которые содержат непротеиногенный аминокислотный остаток Aib ( 2-аминоизомасляная кислота ). Этот остаток сильно индуцирует образование альфа-спиральной структуры. Пептидная последовательность:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = ацетил, Phl = фенилаланинол , Aib = 2-аминоизомасляная кислота )

В клеточных мембранах он образует потенциал- зависимые ионные каналы путем агрегации от четырех до шести молекул .

Биосинтез

Предполагается, что биосинтез аламетицина катализируется аламетицин-синтазой, нерибосомальной пептид- синтазой (NRPS), впервые выделенной в 1975 году. Хотя существует несколько принятых последовательностей пептида аламетицина, данные свидетельствуют о том, что все они следуют общему механизму NRPS с небольшими вариациями в избранных аминокислотах. . Начиная с ацилирования N-конца первой аминоизобутириновой кислоты на ферменте ALM-синтазы ацетил-КоА , за этим следует последовательная конденсация аминокислот каждой модульной единицей синтетазы. Аминокислоты первоначально adenylated с помощью « аденилирования » (А) областей прежде , чем быть прикреплено с помощью тиоэфирных св зи с белком Ацила Carrier -подобного белка - носителя пептидил. Растущая цепь присоединяется к несущему аминокислоту PCP доменом «конденсации» (C), за которым следует еще один цикл тех же реакций в следующем модуле.

Общий механизм синтеза NRPS в аламетицине, показывающий конденсацию аминокислотных субстратов от модуля к модулю. Ac = ацетил Aib = аминоизомасляная кислота. Компоненты модуля: A = аденилилирование PCP = пептидил-несущий белок C = конденсация

Сборка завершается добавлением фенилаланинола, необычного похожего на аминокислоту субстрата. После добавления фенилаланинола завершенная пептидная цепь расщепляется тиоэстеразным доменом, разрывая тиоэфирную связь и оставляя спирт.

Схема отдельных модулей и удлинения биосинтеза аламетицина. Для каждого модуля показана растущая пептидная цепь, оканчивающаяся расщеплением тиоэфира и образованием линейного аламетицина. Ac = ацетил Aib = аминоизомасляная кислота Pheol = фенилаланинол. Компоненты модуля: A = аденилилирование PCP = пептидил-несущий белок C = конденсация

использованная литература

дальнейшее чтение

• Джонс, Л. Р.; Мэддок, ЮАР; Беш, HR-младший (1980). «Демаскирующий эффект аламетицина на (Na +, K +) - АТФазу, аденилатциклазу, связанную с бета-адренергическим рецептором, и активность цАМФ-зависимых протеинкиназ в сердечных сарколеммальных везикулах» . J. Biol. Chem . 255 (20): 9971–9980. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 43488-6 . PMID  6253461 .
• Изучите структуры аламетицина в банке данных по белкам
• Аламетицин в норине
  • Из «Модель потенциалзависимого ионного канала, выведенная из кристаллической структуры аламетицина с разрешением 1,5 A». Fox Jr, RO; Ричардс, FM (1982). «Модель потенциалзависимого ионного канала, выведенная из кристаллической структуры аламетицина с разрешением 1,5 A». Природа . 300 (5890): 325–30. Bibcode : 1982Natur.300..325F . DOI : 10.1038 / 300325a0 . PMID  6292726 . S2CID  4278453 .
• Лейтгеб, Балаж; Секереш, Андраш; Манцингер, Ласло; Вагвёльдьи, Чаба; Kredics, Ласло (01.06.2007). «История аламетицина: обзор наиболее широко изученного пептаибола». Химия и биоразнообразие . 4 (6): 1027–1051. DOI : 10.1002 / cbdv.200790095 . ISSN  1612-1880 . PMID  17589875 . S2CID  40886688 .